Die Humboldt Explorer, ein modernes Schiff von 32m Länge, bietet genügend Platz, um 16 Passagiere unterzubringen. Zwei Kabinen befinden sich auf dem Hauptdeck, sechs weitere Kabinen liegen auf dem Unterdeck. Jede Kabine verfügt über 2 Einzelbetten, aber es besteht die Möglichkeit, ein Doppelbett daraus zu machen. Zudem haben alle Kabinen Meersicht, Klimaanlage, ein privates Badezimmer und einen Flachbildschirmfernseher.
Das Hauptdeck ist bestens auf die Bedürfnisse von Tauchern abgestimmt: grosser Tisch, wo man auch heikle Ausrüstungsteile wie Fotoapparate, Lampen usw. abstellen kann, Aufladestation für Batterien, Spülbecken, individuelle Ablageplätze sowie ein Badezimmer. Gleich hinter dem Tauchabteil befindet sich ein Salon, wo die Mahlzeiten eingenommen werden.
Die Terrasse auf dem Oberdeck verwöhnt die Gäste mit einem Hauch Luxus: Whirlpool, Liegestühle, grosser Bereich mit Sitzgelegenheiten.